据雅加达邮报5月31日报道：周一（5月30日），中国就印尼扣押中国渔船事件向印尼提出严厉抗议。

与此同时，中国在南海的填海活动以及与其他东南亚国家关于南海关键航道的主权争议也在加剧中国南海紧张局势。

印尼军方表示，5月27日，一艘中国船只进入了资源丰富的纳土纳海域婆罗洲岛西北海岸水域印尼专属经济区，印尼军方在进行多次警告后将其扣押。印尼军方上周日（5月29日）表示，这次扣押中国渔船事件是印尼向全世界发出的信号：印尼将会严厉打击违反其管辖的船只。

中国也以“严正交涉”回应印尼。中国外交部发言人华春莹在周一（5月30日）召开的外交部例行记者会中说：对于事发海域，中国和印尼有不同看法，中国渔船在此进行正常的生产作业。中方已向印尼方提出严正交涉。